任何一个区域的y染色体微缺失都属于染色体异常，而染色体异常就符合第三代试管指征，所以无论是哪一类y染色体微缺失都符合第三代试管指征，此部分患者在有生育需求的时候，可以直接选择第三代试管婴儿技术进行助孕，以提高妊娠率、降低流产率以及提高生育健康宝宝的几率。要知道的是，y染色体微缺失通常有AZFa、AZFb和AZFc三个区域，其中c区比较常见，a区非常罕见。
y染色体微缺失指的就是y染色体上的基因出现了微小的缺失，该缺失可以出现在任何一个区域，但是在临床上，y染色体微缺失主要发生在AZFa、AZFb和AZFc三个区域。无论y染色体上的哪一区域出现了微缺失的情况，都属于染色体异常问题之一，而三代试管婴儿指征就包括了染色体异常问题，也就符合三代试管婴儿指征，即此部分患者可以选择三代试管技术进行助孕。
对于y染色体微缺失且利用三代试管技术助孕的夫妻来说，虽然在移植胚胎前，实验室人员会去胚胎遗传物质进行筛查与诊断，但是由于该项技术的助孕成功率通常在60%-70%，并未达到助孕，也就会使得部分患者的老婆在怀孕之后，还是会有生出y染色体微缺失宝宝的概率。当然要知道的是，y染色体只有男性才有，即只有生孩子孩才会有遗传到的概率，生孩子孩是不会存在遗传的。
